NGSデーターアセンブルについて

我々が研究対象としている植物のゲノムの454データが公開されていた。
早速NCBIよりデータをダウンロードした。
データ量は12G余り。
早速、velvetでアセンブル。
454なのでk値を51でアセンブル。
我々のサーバーのメモリを超えswapに入り計算を続けるも
途中で終了。
今度は、K値を91にセットして計算スタート。
明日には結果が出てるか

結局、Newblerにてアセンブルしたものが一番良かった。
CLCも満足行く結果であった。
velvetはメモリ不足で断念。