Ray

Rayインストールメモ

export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/lib
echo $LD_LIBRARY_PATH

mpirun -np 1 Ray --help
mpirun -np 1 Ray Commands.Ray

mpirun -np 32 Ray -p SRR001665_1.fastq SRR001665_2.fastq -p SRR001666_1.fastq SRR001666_2.fastq -a

mpirun -np 8 Ray -s DRR000001_1.fastq -s DRR000001_2.fastq -a DRR.afg


time mpirun -np 4 ./ABYSS-P -k21 /root/Desktop/DRR000001_1.fastq /root/Desktop/DRR000001_2.fastq -o /abyss112/contig.fa



.bash_profile の編集
.bash_profile の中に PATH=$PATH:〜 と export の記述を追加

環境変数の設定をサーバ内の全ユーザに対して指定したい場合
/etc/profile ファイルを開き、
末尾に PATH=$PATH:〜 と export を追加する方法